SG-1 ist schockiert als General Hammond sie zu sich bittet und ihnen klarmacht, dass er sich in den Ruhestand begibt. Kurzerhand wird er durch General Bauer ersetzt, der den  Skrupel in Person ist. 

SG-1 wird aufgelöst und das ganze SGC umstrukturiert. Als er dann auch noch Carter damit beauftragt, eine Naquadabombe zu bauen und geheime Experimente auf einem Fremden Planeten ausführt, platzt Jack der Kragen und will den richtigen Grund herausfinden, weshalb sich George zur Ruhe gesetzt hat. Und tatsächlich, was Jack bei seinen Nachforschungen herausfindet, ist unglaublich und beängstigend zugleich. 

Hammond wurde von oberster Stelle abkommandiert, da er sich weigertetraterrestrische Technologie um jeden Preis für die Menschheit verfügbar zu machen. 

Jack versucht nun alles um das N.I.D zu übergehen und "ihren" General wieder zurückzubekommen. Doch dies erweist sich schwieriger als bisher angenommen und so muss sich O'Neill ausgerechnet mit seinem inhaftierten "Lieblingsfreund" Colonel Maybourne zusammenarbeiten.

Wird Jack mit dessen Hilfe es gelingen, General Hammond zurückzuholen und die Dinge im N.I.D wieder zurechtzurücken, oder müssen sie sich dem Wahnsinnigen General Bauer untergeben, der schon den nächsten Bombentest auf einem anderen Planeten plant?